來源:《中國科學(xué)報》
發(fā)布時間:2020-07-07
本報訊(記者劉萬生 通訊員鄭福建)近日,中科院大連化學(xué)物理研究所研究員許國旺團隊對率先提出并發(fā)展的擬靶向代謝組學(xué)檢測方法進行了系統(tǒng)總結(jié)和提升,并形成范本,相關(guān)成果發(fā)表于《自然—實驗手冊》。
代謝組學(xué)對內(nèi)源性代謝物進行前景的定性和定量分析,找出差異代謝物,用于藥物靶點發(fā)現(xiàn)、疾病機理研究等。其分析策略主要有非靶向和靶向兩種,前者信息豐富,但存在數(shù)據(jù)復(fù)雜、重復(fù)性差、線性范圍窄等缺點;后者數(shù)據(jù)質(zhì)量好,但通常只能檢測已知代謝物,覆蓋度低。
針對上述問題,研究團隊于2012年首次提出擬靶向代謝組學(xué)的概念,將非靶向和靶向代謝組學(xué)檢測方法“強強結(jié)合”,使得已知和未知的代謝物均可被測量,兼具非靶向和靶向代謝組學(xué)方法的優(yōu)點。
研究人員不斷對該方法進行完善和提升,開發(fā)了大量相關(guān)軟件,建立了針對大規(guī)模臨床樣本分析的數(shù)據(jù)校正方法,獲得了很好的重復(fù)性。在此基礎(chǔ)上,在不同色譜—質(zhì)譜檢測體系中分別建立了對血漿、尿液、植物樣品等的擬靶向代謝組學(xué)和脂質(zhì)組學(xué)方法。
近期團隊對該方法又有創(chuàng)新,應(yīng)用二維液相色譜—質(zhì)譜技術(shù)在正離子模式和負(fù)離子模式下分別檢測到1294和687個離子對,分別對應(yīng)1609和847個潛在代謝物或脂質(zhì)。而基于化學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品的傳統(tǒng)靶向方法,通常只能檢測幾十到幾百個代謝物或脂質(zhì)。新方法可用于分離分析氨基酸、膽汁酸、肉堿等,已在惡性腫瘤(肝癌、肺癌)和糖尿病等代謝性疾病的研究中發(fā)揮積極作用。
團隊還進一步優(yōu)化了擬靶向代謝組學(xué)檢測方法建立流程,升級了開放式軟件和工具,形成了方法范本,為領(lǐng)域內(nèi)同行更好地利用該方法提供理論和操作指南。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41596-020-0341-5
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